ImmGen: Verkenning van Genexpressie
ImmGen is een educatieve applicatie voor iPhone die gebruikers in staat stelt om genexpressieniveaus in verschillende immuuncellen van muizen en mensen te verkennen. De app biedt een gebruiksvriendelijke interface waarbij gebruikers eenvoudig een gennaam of alias kunnen invoeren in de zoekbalk. Vervolgens kunnen ze door een lijst van resultaten bladeren en de expressie van het gen in verschillende celtypes zoals B-cellen, T-cellen en myeloïde cellen bekijken.
Meest gekozen alternatief
De applicatie bevat een 'heatmap barcode' die de expressie-intensiteit van het gen toont in verschillende cel lijnens, met de mogelijkheid om te schakelen tussen drie datasets: muis RNA-seq, muis microarray en menselijke RNA-seq. Gebruikers kunnen ook een staafdiagram bekijken door op de celtypel te drukken, en de instellingen aanpassen voor een log- of lineaire as. Daarnaast biedt de optie 'Gerelateerde genen weergeven' een overzicht van de meest gecorreleerde genen binnen bepaalde populatiegroepen.
